「Hitsugi_planimetry」の使用方法

2023年12月29日コンピューターソフトHitsugi_planimetry

ダウンロードはこちらから。

動作環境

Windows10,11で動作を確認しています。
Macはご利用になれません。

用意するもの

下のような、スケールバーが入った画像。

胞子の画像

設定方法

①Setting.exeをダブルクリック。

②用意した「スケールバーの入った画像を選択。

③画像が表示される。

④スケールバーの左端をクリックする。

クリックすると、右の画像のように赤い点が描画される。

スケールバーの拡大画像

⑤同様に、スケールバーの右端をクリックする。

右の画像のように、両端に赤い点があることを確認。

スケールバーの拡大画像

⑥クリックする。

右のようなダイアログが表示される。

ダイアログ

⑦スケールバーの値、スケールバーの単位、求めたい面積の値を選択する。
(画像の場合、スケールバーの値は50、スケールバーの単位はμm)

⑧設定完了を押す。

※スケールバーのpx数がわかっている場合は、config.iniファイルを直接変更する方法もある
(後述)。

使用方法

①上記の設定を終わらせる。
・スケールが変わらない場合は、設定を変更する必要なし。
・スケールを変えた場合や顕微鏡、撮影方法を変えた場合は再度設定をし直す。

②Hitsugi_planimetry.exeをダブルクリック。

③面積を測定したい画像を選択。

画像とダイアログウィンドウが表示される。

画像とダイアログ

④適切な染色がなされるまで、閾値の値を変更し、再読み込みを押す。

右のように赤く染色される。

画像とダイアログ

⑤測定したい部分の周りを時計回り(反時計回り)でクリックしていく。

クリックすると青い点が描画される。

画像とダイアログ

右クリックする。

切り取られた画像が表示される。
この操作を行って時点で、切り取られた画像が元の画像と同じフォルダに
「(元の画像の名前)-cropped」
という名前で保存される。

画像とダイアログ

⑦面積値をコピーボタンを押すことで、面積値がコピーされる。

・染色をやり直したい場合は、閾値を変更して再読み込み。
・切り取りをやり直したい場合は、閾値を変更せず再読み込み。
・続けて別の画像の面積を測定したい場合は、別の画像を選択。
・終了する場合は、終了。

設定方法(config.iniファイルを直接変更)

①config.iniファイルをメモ帳で開く。

②下記のようなテキストが書き込まれているため、適宜変更する。

[setting]
idialog = C:\デスクトップ
threshold = 30.0
scale = 50
unit = um
scalebar_px = 108
areaunit = m

idialog : 切り取った画像の保存場所。
threshold : 初期閾値
scale : スケールバーの値
unit : スケールバーの単位 (μmはum)
scalebar_px : スケールバーのpx数
areaunit : 面積の単位 (m2は省略)

使用可能な単位
pm、nm、μm、mm、cm、m

書き換えた結果、ソフトが正常に作動しなくなった場合は、上記のテキストをそのままコピーして上書きするか、再ダウンロードしてください。

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自称システムエンジニアのくせに、農学系の地方国立大に通うおかしな生き物。 ひつぎ教育研究所社長。